Forskjell mellom roten og ikke-roterende fylogenetisk tre | Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Hovedforskjell - Roterte vs Uvirket Phylogenetisk Trær
Phylogeny er et viktig felt som utforsker livet på jorden gjennom tiden. Det avslører forbindelsen mellom organismer med sine forfedre og etterkommere. Forholdet mellom organismer er diagrammatisk representert av forskjellige trelignende representasjoner som dendogram, kladogram, fenogram, fylogenografi etc. Et fylogenetisk tre er et forgrenende trelignende diagram som forklarer fylogenetiske forhold mellom organismer med mengden evolusjonær avstand. Det er to hovedtyper av fylogenetiske trær kjent som rotfestet og ubebygget. Nøkkelforskjellen mellom det rotte og det uløste fylogenetiske treet er at rotfestet tre viser den mest basale forfederen til treet mens ikke-rødt fylogenetisk tre ikke viser en stamfødte rot.
INNHOLD
en. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er et roten filogenetisk tre
3. Hva er et uutviklet fylogenetisk tre
4. Side ved side-sammenligning - Rødt mot ubeskyttet fylogenetisk tre
5. Sammendrag
Hva er et roten filogenetisk tre?
Et rotert fylogenetisk tre tjener som et nyttig diagram som viser evolusjonær historien. Den har en basal knutepunkt som kalles roten, som representerer den felles forfederen til alle gruppene av treet. Roten av et tre betraktes som det eldste punktet i treet som representerer den siste vanlige forfederen til alle grupper som er inkludert i treet. Et rotfestet tre viser derfor evolusjonstidens retning. Fra en enkelt art av et rotfestet tre, kan den felles forfedre eller arten forfedre bli funnet ved å spore tilbake til basalnoden. Siden det rotte treet skildrer retningen for evolusjonstid, er det lett å finne de eldre eller nyere gruppene den har. Et rotfestet tre kan brukes til å studere hele gruppen av organismer. Nøyaktig rotering av et fylogenetisk tre er en viktig og avgjørende faktor fordi unøyaktig oppretting kan føre til feil fortolkning av genetiske endringer mellom organismer og deres retningsstil i utviklingen.
Figur 01: Et rotert fylogenetisk tre
Hva er et ikke-roterende fylogenetisk tre?
Et uløftet fylogenetisk tre er et fylogenetisk diagram som mangler en felles forfader eller en basal knutepunkt. Denne typen av tre angir ikke utviklingen av gruppene av interesse.Den avbilder bare forholdet mellom organismer uavhengig av retningen for evolusjonstidslinjen. Derfor er det vanskelig å studere de evolusjonære relasjonene til gruppene med tanke på tiden ved hjelp av et urørt tre.
Det er to hovedveier å rote et ikke-roterende fylogenetisk tre. De er
- Finne en utgående gruppe - Dette krever forkunnskap om forholdet mellom taxa. Deretter kan et taxon som ligger utenfor gruppen brukes som en utgrodd for å tegne et rotert fylogenetisk tre
- Finne midtpunktet eller avstanden - Midtpunktet til de fjerneste to taxaene i treet kan antas som en rot for det fylogenetiske treet.
Figur 02: Et ufortyndet fylogenetisk tre
Hva er forskjellen mellom rødt og ikke-roterende fylogenetisk tre?
- diff Artikkel Mellom før Tabell ->
Rødt mot ubeskyttet fylogenetisk tre |
|
| Et rotert fylogenetisk tre er et diagram som viser gruppens siste felles forfader. | Et uavhengig fylogenetisk tre viser forholdet mellom organismer uten å vise felles forfedre. |
| Node | |
| Den har en node (root). | Det har ikke en node. |
| Evolutionens retning | |
| Den har retning for å indikere evolusjonstid. | Det angir ikke et evolusjonært forhold. |
| Hengivenhet mot andre | |
| Treet tillater å bestemme forfedrenes etterkommere forhold mellom grupper. | Træret tillater ikke å snakke om forfedre - etterkommere forhold. |
Sammendrag - Rødt mot ubeskyttet fylogenetisk tre
Et fylogenetisk tre representerer evolusjonære veier og forbindelser mellom organismer ved hjelp av forgrenede tre-lignende diagrammer. Phylogenetic tress kan være forankret eller uopprettet. Et rotfestet tre har en knutepunkt i basen, som representerer den felles forfederen som forbinder alle interessegrupper. Et urørt tre viser forholdet mellom organismer. Det skildrer imidlertid ikke den felles forfederen som alle gruppene deler. Dette er forskjellen mellom roten og ikke-roterende fylogenetisk tre.
Referanser:
1. "Tree" Fakta: Rødt versus Unrooted Trees. "Nasjonalt senter for bioteknologisk informasjon. U. S. National Library of Medicine, n. d. Web. 04. april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead, og Spencer C. H. Barrett. "Roterende filogenetriske trær med fjerngrupper: En case studie fra Commelinoid Monocots. "Molekylærbiologi og evolusjon. Oxford University Press, 01. oktober 2002. Web. 04 april 2017
