Forskjell mellom Alpha Helix og Beta Plated Sheet | Alpha Helix og Beta Plated Sheet

Nøkkelforskjell - Alpha Helix vs Beta Plated Sheet

Alfa-helixer og beta-plissede ark er de to mest brukte sekundære strukturer i en polypeptidkjede. Disse to strukturelle komponentene er de første hovedtrinnene i prosessen med å brette en polypeptidkjede. nøkkelforskjellen mellom Alpha Helix og Beta Plated Sheet er i deres struktur ; de har to forskjellige former for å gjøre en bestemt jobb.

Hva er Alpha Helix?

En alfa helix er en høyrehendt spole av aminosyrerester på en polypeptidkjede. Utvalget av aminosyrerester kan variere fra 4 til 40 rester. Hydrogenbindingene dannet mellom oksygenet av C = O-gruppen på toppspolen og hydrogenet av N-H-gruppen i bunnspolen bidrar til å holde spolen sammen. En hydrogenbinding dannes per hver fire aminosyrerester i kjeden på ovennevnte måte. Dette ensartede mønsteret gir det bestemte egenskaper som tykkelsen på spolen, og den dikterer lengden på hver komplett sving langs spiralaksen. Stabiliteten av alfa-helixstrukturen er avhengig av flere faktorer.

O-atomer i rødt, N-atomer i blått og hydrogenbindinger som grønne stiplede linjer

Hva er Beta-plater?

Beta-plater, også kjent som betongark, betraktes som den andre form for sekundær struktur i proteiner. Den inneholder betongstenger som er koblet sidelengs med minst to eller tre ryggradsvannbindinger for å danne et vridd, plissert ark som vist på bildet. En beta-streng er en strekk av polypeptidkjede; lengden er vanligvis lik 3 til 10 aminosyrer, inkludert ryggrad i en utvidet bekreftelse.

4-strengs antiparallell P-fragment fra en krystallstruktur av enzymet katalase.

a) viser de antiparallelle hydrogenbindingene (prikket) mellom peptid-NH- og CO-grupper på tilstøtende tråder. Pilene indikerer kjederetning, og elektrondensitetskonturene skisserer ikke-H-atomer. O-atomer er røde baller, N-atomer er blå, og H-atomer utelates for enkelhet; sidekjeder vises bare ut til det første sidekainet C-atom (grønt)

b) Kanten på de sentrale to β-strengene

I betongplater, løper polypeptidkjedene langs hverandre. Det blir navnet "plissert ark" på grunn av det bølgelignende utseendet på strukturen. De er koblet sammen av hydrogenbindinger.Denne strukturen tillater dannelse av flere hydrogenbindinger ved å strekke ut polypeptidkjeden.

Hva er forskjellen mellom Alpha Helix og Beta Plated Sheet?

Struktur av Alpha Helix og Beta Plated Sheet

Alpha Helix:

I denne strukturen er polypeptid-ryggraden tett bundet rundt en imaginær akse som en spiralstruktur. Det er også kjent som den helikoidale arrangement av peptidkjeden.

Dannelsen av alfa-helixstruktur skjer når polypeptidkjedene er vridd i en spiral. Dette gjør det mulig for alle aminosyrene i kjeden å danne hydrogenbindinger (en binding mellom et oksygenmolekyl og et hydrogenmolekyl) med hverandre. Hydrogenbindingene tillater at spiralen holder spiralformen og gir en tett spole. Denne spiralformen gjør alfa helixen veldig sterk.

Hydrogenbindinger er indikert av de gule prikkene.

Beta-plater:

Når to eller flere fragmenter av polypeptidkjeder overlapper hverandre, danner en rekke hydrogenbindinger med hverandre, kan følgende strukturer bli funnet. Det kan skje på to måter; parallellarrangement og parallellarrangement.

Eksempler på strukturen:

Alfa Helix: Fingernailer eller tånegler kan tas som et eksempel på en alfa-helixstruktur.

Beta-plater: Strukturen av fjær ligner strukturen på betongplater.

Funksjonene i strukturen:

Alfa Helix: I alfa helix-struktur er det 3. 6 aminosyrer per helix. Alle peptidbindingene er trans og plane, og N-H-gruppene i peptidbindingene peker i samme retning, som er omtrent parallelt med helixens akse. C = O-gruppene av alle peptidbindinger peker i motsatt retning, og de er parallelle med helixens akse. C = O-gruppen av hver peptidbinding er bundet til N-H-gruppen av peptidbindingen som danner en hydrogenbinding. Alle R-gruppene peker utover fra helixen.

Beta-plater: Hver peptidbinding i beta-plisseret ark er plan og har trans-konformasjon. C = O- og N-H-gruppene av peptidbindinger fra tilstøtende kjeder er i samme plan og peker mot hverandre som danner hydrogenbinding mellom dem. Alle R-gruppene i en hvilken som helst kjede kan alternativt forekomme over og under arkets plan.

Definisjoner:

Sekundær struktur: Det er formen på et brettprotein på grunn av hydrogenbinding mellom ryggradamid og karbonylgrupper.

Referanser: "Proteinstruktur". ChemWiki: Den sekundære strukturen for dynamisk kjemi Hypertext "α-Helices and β-Sheets". Proteinstructures. com av Salam Al Karadaghi "Organic Chemistry". Virtual Cell læreboken "Beta Sheet". Wikipedia Image Courtesy: "Helix electron density density myoglobin 2nrl 17-32" Av Dcrjsr - Eget arbeid (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia "Protein sekundær struktur" av en: Bruker: Bikadi (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia "1gwe antipar beta blad begge" av Dcrjsr - Eget arbeid (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia