Forskjell mellom VNTR og STR | VNTR vs STR

Nøkkelforskjell - VNTR vs STR

DNA-studier har enorm hjelp ved å forstå og bestemme fylogenetiske relasjoner, diagnostisere genetiske sykdommer og kartlegge organismerens genomer. Flere teknikker assosiert med DNA analyse blir brukt for å identifisere et bestemt gen eller en DNA-sekvens i et basseng av ukjent DNA. De er kjent som genetiske markører. Genetiske markører brukes i molekylærbiologi for å identifisere genetisk variasjon mellom individer og arter. Variabelt antall tandemrepetisjon (VNTR) og kort tandemrepetisjon (STR) er to typer genetiske markører som viser polymorfisme hos enkeltpersoner. Begge typer er ikke-kodende repetitive DNA som er tandem-gjentakelser. De er arrangert i hodet til hale i kromosomer. VNTR er en del av genomet hvor kort nukleotidsekvens gjentas flere ganger. STR er en annen del av DNA i genomet som er organisert som repeterende enheter bestående av to til tretten nukleotider i hundre ganger. Hovedforskjellen mellom VNTR og STR er antall nukleotider i en repeterende sekvens. Gjentatte enheter av VNTR består av 10 til 100 nukleotider, mens repeterende enhet av STR består av 2 til 13 nukleotider . VNTR og STR brukes mye i rettsmedisinske studier.

INNHOLD

en. Oversikt og nøkkelforskjell

2. Hva er VNTR

3. Hva er STR

4. Likheter mellom VNTR og STR

5. Side ved side-sammenligning - VNTR vs STR i tabellform

6. Sammendrag

Hva er VNTR?

En tandem gjentagelse er en kort sekvens av DNA som gjentas i hodet til hale mot et bestemt kromosomalt lokus. Det er ingen annen sekvens eller nukleotid innenfor tandemrepetisjonen. Det er flere typer tandem gjentakelser i genomet. VNTR er en type tandemrepetisjon blant dem som har repeterende enheter som består av 10 til 100 nukleotider. VNTR er en type minisatellitt. Disse tandem-gjentakelsene finnes i mange kromosomer. De er interspersed i det menneskelige genom og ligger overveiende i de subtelomere områdene av kromosomer.

VNTRs viser tandem-repetisjon polymorfisme hos enkeltpersoner. Lengden av VNTR i en bestemt plassering av kromosomet er svært variabel blant individer på grunn av variasjonen i antall repeterende enheter organisert i den DNA-delen. Derfor kan VNTR brukes som et kraftig verktøy for identifisering av individer, og VNTR-analysen brukes på mange områder, inkludert genetikk, biologiforskning, rettsmedisin og DNA-fingerutskrift.VNTR var de første genetiske markørene som ble brukt til å kvantifisere benmargtransplantasjons engraftment. VNTRs var også de første polymorfe markørene som ble brukt i DNA-profilering i rettsmedisin.

Figur 3: Variasjon av VNTR i seks individer

VNTR-analyse utføres via begrensningsfragmentlengdepolymorfisme etterfulgt av sørlig hybridisering. Derfor trenger det forholdsvis en stor DNA-prøve. VNTR profil tolkning er også problematisk. På grunn av disse begrensningene har bruken av VNTR i rettsmedisin blitt begrenset, og den er erstattet av STR-analyse.

Hva er STR?

STR er en svært repeterende DNA-seksjon som består av to til tretten nukleotid-repeterende enheter organisert på en tandem måte. STR er lik VNTR. Men det varierer fra VNTR fra antall nukleotider i en gjentakende sekvens og antall gjentagelser. STR er en type mikrosatellitt.

STR analyse involvert i måling av det eksakte antall repeterende enheter. STR er svært variabel blant enkeltpersoner, lik VNT. STR-profiler varierer fra person til person. Derfor benyttes STR analyse i molekylærbiologi for å sammenligne spesifikke loki på DNA fra to eller flere prøver. Derfor er STRs betraktet som kraftige genetiske markører i molekylærbiologi. Det gir et utmerket verktøy for identifisering av individer på grunn av deres høye grad av polymorfisme og relativt kort lengde.

For tiden er STRs det mest brukte analyserte genetiske polymorfisjonsverktøyet i rettsmedisinske genetikk. De fleste rettsmedisinske saker innebærer STR polymorf analyse. STR loci er spredt gjennom genomet. Det er tusenvis av STR som ligger i kromosomer som kan brukes i rettsmedisinsk analyse. STR-analyse involverer ikke begrensningslengdepolymorfisme som VNTR-analyse. STR-analyse kutter ikke DNA med restriksjonsenzymer. Spesifikke prober brukes til å feste ønskede områder på DNA og ved bruk av PCR-teknikk, bestemmes lengden av STR.

Figur 02: STR variasjon mellom prøver

Hva er likhetene mellom VNTR og STR?

VNTR og STR er ikke-kodende DNA.

Begge er tandem gjentakelser.
Begge viser polymorfisme blant individer på grunn av forskjellen i DNA-seksjonens lengde.
Begge brukes som kraftige genetiske markører i DNA fingeravtrykk og i rettsmedisinske studier.
Hva er forskjellen mellom VNTR og STR?

- diff Artikkel Midt før tabell ->

VNTR vs STR

VNTR er et ikke-kodende repetitivt DNA som har en kort nukleotidsekvens gjentatt på en tandem måte.
STR er en svært repeterende DNA-seksjon som består av to til tretten nukleotid-repeterende enheter organisert på en tandem måte.	Størrelse
VNTR er større enn STRs.
STR er mindre enn VNTRs.	Antall nukleotider i gjentakende sekvens
Den gjentatte enheten av VNTR består av 10 til 100 nukleotider.
Den gjentatte enheten av STR består av 2 til 13 nukleotider.	Sammendrag - VNTR vs STR

VNTR og STR er to kraftige genetiske markører som brukes i molekylærbiologi, særlig innen rettsmedisin.VNTR er en type minisatellitt og STR er en mikrosatellitt. VNTR og STR er ikke-kodende, svært repeterende DNA. De er tandem gjentakelser. Den generelle strukturen til VNTR og STR er den samme. Antallet nukleotider i den gjentatte sekvensen og lengden er imidlertid forskjellige. VNTR har repeterende sekvenser består av 10 til 100 nukleotider. STR har repeterende sekvenser som består av 2 til 13 nukleotider. Dette er forskjellen mellom VNTR og STR.

Last ned PDF-versjonen av VNTR vs STR

Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til offline-formål som i sitatnotater. Vennligst last ned PDF-versjon her Forskjellen mellom VNTR og STR.

Referanser:

1. "The Science of Forensic Genetics. "CRG - Rådet for ansvarlig genetikk. N. p., n. d. Web. Tilgjengelig her. 10. juli 2017.

2. "STR analyse. "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22. mars 2017. Web. Tilgjengelig her. 10. juli 2017.

Image Courtesy: