Forskjell mellom Metabolomics og Metabonomics | Metabolomics vs Metabonomics
Key Difference - Metabolomics vs Metabonomics
Metabolitter er de små molekylene som er involvert i metabolske reaksjoner i cellene. Metabolitter inkluderer metabolske mellomprodukter, hormoner, sekundære metabolitter, signalmolekyler, etc. De er de fungerende molekyler av biokjemiske reaksjoner av cellene. Et komplett sett med metabolitter av en biologisk prøve eller en enkelt organisme er kjent som metabolom. Metabolom er en dynamisk samling som endres hvert sekund i kroppen. Metabolomics og metabonomics er to termer relatert til studien av metabolisme av en organisme. Hovedforskjellen mellom metabolomikk og metabonomics er at metabolomikk er mer opptatt av normal endogen metabolisme og metabolske profilering på celle eller organ-nivå mens metabonomics er mer opptatt av forløp metabolske profilering med informasjonen av forstyrrelser av metabolismen på grunn av miljøfaktorer, sykdommer, tarmmikroorganismer og å sammenligne metabolske profilering, etc. Metabolomics drives i hovedsak ved hjelp av massespektrometri, og metabonomics benytter NMR-spektroskopi for metabolitt-analyse.
INNHOLD
en. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er Metabolomics
3. Hva er Metabonomics
4. Side ved side-sammenligning - Metabolomics vs Metabonomics
5. Sammendrag
Hva er Metabolomics?
Metabolomics er studien av metabolske prosesser som forekommer i celler, biofluider, vev eller organismer. Den omfatter identifisering og kvantifisering av cellulære metabolitter ved bruk av gode analytiske og statistiske verktøy. Metabolomics anses som en viktig studie siden den avslører informasjon om metabolismen av en organisme.
For å studere substrater og produkter av metabolske reaksjoner bruker metabolomics massespektrometri som en analytisk plattform. Massespektrometri avslører typer metabolitter og deres konsentrasjoner, som reflekterer den faktiske biokjemiske tilstanden til cellene eller vevet. Derfor kan metabolomics anses som den beste representanten for molekylær fenotype av en organisme. Metabolomics er en omisk teknologi av små molekyler av organismer og sammenlignet med andre omiske studier; metabolomics er svært viktig siden den gjenspeiler gjeldende status for cellens biokjemiske reaksjon.
Metabolomikk kan også betraktes som en forlengelse av proteomikk fordi de genereres på grunn av aktivitetene av enzymer som er proteiner som vist i den følgende figur.
Figur 01: Metabolomics-skjema
Hva er Metabonomics?
Metabonomikk er definert som en kvantitativ måling av multiparametriske metabolske responser ved bestemte tider i forhold til patofysiologiske stress eller genetisk modifikasjon. Dette brukes vanligvis på studier utført om menneskelig ernæring og respons på rusmidler eller sykdommer. Denne tilnærmingen ble pionerert av Jeremy Nicholson ved Imperial College, London, og den har blitt brukt på en rekke områder, inkludert toksikologi, sykdomsdiagnose, ernæring, etc. Historisk var metabonomi en av de første metodene for å anvende omfanget av systembiologi til studier av stoffskiftet.
Metabonomikk er mer opptatt av å sammenligne biokjemiske profiler enn å identifisere individuelle metabolske forbindelser i metabolomics. Derfor kan metabonomi defineres som en delmengde av metabolomics. Det legger hovedsakelig vekt på sammenligning av metabolske profiler av forskjellige populasjoner med hensyn til sykdommer, miljøspenninger, genetisk modifikasjon, ernæring, narkotika etc. fordi metabolitter er de gode markørene som signaliserer sykdomsforholdene, virkninger av legemidler, miljøbelastninger, eksponering for toksiner, etc.
Metabonomiske studier avslører både intracellulære og ekstracellulære metabolitter. Det bruker høye gjennomstrømmingsteknikker for å analysere et stort antall metabolitter samtidig og gjentatte ganger, slik at det blir mulig å foreta en tidsundersøkelse av cellens fysiologiske status. Det avslører også sammenhengen mellom metabolitter og patologisk status av organismen. For å støtte metabonomiske studier kan genomics og proteomics brukes siden de er sammenhengende som vist i figuren ovenfor.
Hva er forskjellen mellom Metabolomics og Metabonomics?
Metabolomikk er studien av det komplette settet av metabolitter av en organisme.
Metabonomi er den kvantitative studien av multiparametriske metabolske responser av levende systemer i tidsmessige grunner. til patofysiologiske stimuli eller genetisk modifikasjon. |
|
Hovedbetennelse | Metabolomics er mer opptatt av metabolsk profilering og identifisering av individuelle metabolitter tilstede i cellene. |
Metabonomi er mer opptatt av å sammenligne metabolitter eller metabolske profiler av populasjoner i forhold til genetiske modifikasjoner, sykdommer, miljøspenninger, patologiske stimuli, narkotika etc. | |
Informasjon | Metabolomikk er hovedsakelig fokusert på endogen metabolisme. |
Metabonomikk er ikke begrenset til endogen metabolisme. Det strekker seg for å finne informasjon om forstyrrelser av metabolisme forårsaket av interne og eksterne faktorer som diettmønstre, toksiner, sykdomsprosesser, etc. | |
Analytiske verktøy | Det bruker massespektrometri som den viktigste analytiske plattformen |
Metabonomics bruker NMR spektroskopi som den viktigste analytiske plattformen. | |
Sammendrag - Metabolomics vs Metabonomics | Metabolom representerer det komplette settet av små molekyler som kalles metabolitter tilstede i en celle eller i en organisme.Metabolomics er studien av hele metabolomet for å generere metabolsk profil. Metabolomics tillater forskere å måle den faktiske fysiologiske statusen til cellen eller organismen. Metabonomikk er en del av metabolomics som strekker seg til å trekke ut opplysninger om de multiparametriske metabolske responsene til levende systemer til patofysiologiske stimuli og genetiske modifikasjoner. Metabonomi er ikke bare opptatt av individuell metabolsk profilering som metabolomics; det sammenligner metabolske profiler i forhold til andre faktorer som miljøspenninger, sykdommer, toksiner, etc. Både metabolomics og metabonomics involverer studier av metabolitter av organismer for å måle cellens faktiske fysiologiske status. Derfor blir disse to ganger noen ganger betraktet som synonymer, uten å vurdere forskjellen mellom metabolomics og metabonomics. |
Referanse:
1. Roessner, Ute og Jairus Bowne. "Hva handler metabolomics om. "BioTechniques - Hva handler metabolomics om? N. p., April 2009. Web. 24. april 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomics and Metabonomics. "Springer. Springer London, 01 jan. 1970. Web. 25. april 2017
Image Courtesy:
1. "Metabolomics Schema" Av LMaps (Talk) - Own Work (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia